RNA-Seq
RNA-Seq データ解析に関する記事一覧。マッピング、発現定量、新規アセンブリなど。
記事一覧
- Bowtie2でRNA-seqデータをトランスクリプトームへマッピングする
- eXpress で RNA-seq データから発現量を計算する
- reference transcriptome
- RNA-seq データからの rRNA除去
- RNA-seqのリードをHISAT2でゲノムへ高速にマッピングする
- RNA-seqのリードをSTARでゲノムへ高速にマッピングする
- RNA-Seqのトランスクリプトへのリードカバレッジを確認する
- sailfishでアライメントなしに高速に発現定量する
- TopHatでRNA-seq のデータをリファレンスゲノムへマッピングする
- 遺伝子発現量(FPKM)を計算する
- 発現が有意に異なる遺伝子を探す