sailfishでアライメントなしに高速に発現定量する

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sailfish は実行可能なバイナリ形式の配布があるが、ここではソースコードからコンパイルする方法を述べる。

まずは boost をインストールする。 boost とはプログラミング言語C++のライブラリで、sailfish はこのライブラリの機能を利用しているため、事前にインストールしておく必要がある。

wget http://downloads.sourceforge.net/project/boost/boost/1.60.0/boost_1_60_0.tar.bz2
tar jxvf boost_1_60_0.tar.bz2
./bootstrap.sh --prefix=/home/itoshi/opt/local
./b2 install

次に sailfish をインストールする。

git clone git@github.com:kingsfordgroup/sailfish.git
cd sailfish
mkdir build
cd build
cmake -DBOOST_ROOT=/home/itoshi/opt -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/itoshi/opt/local ..

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